Produktet

Kohët e fundit kemi raportuar se nukleotidi i pirenit preferohet të futet përballë një zone abazike, 3'-T e një dimeri të timinës dhe bazave më të padëmtuara nga polimeraza e ADN-së së majave dhe (pol eta).Për shkak se pireni është një molekulë jopolare pa aftësi të lidhjes H, efikasiteti jashtëzakonisht i lartë i futjes së dPMP i atribuohet aftësisë së tij superiore të grumbullimit të bazës dhe nënvizon rëndësinë e grumbullimit të bazës në përzgjedhjen e nukleotideve nga pol eta.Për të hetuar rolin e lidhjes H dhe gjeometrisë së çiftit të bazës në përzgjedhjen e nukleotideve nga pol eta, ne përcaktuam efikasitetin e futjes së nukleotideve të modifikuara me bazë 2,6-diaminopurinë, 2-aminopurinë, 6-kloropurinë dhe inozinë që do të bëni një numër të ndryshëm lidhjesh H me bazën e shabllonit në varësi të gjeometrisë së çiftit të bazës.Çiftimi i bazës Watson-Crick duket se luan një rol të rëndësishëm në përzgjedhjen e analogëve të nukleotideve për futjen përballë C dhe T siç dëshmohet nga ulja e efikasitetit relativ të futjes me një ulje të numrit të lidhjeve Watson-Crick H dhe një rritje në numri i ndërveprimeve donator-donator dhe pranues-pranues.Selektiviteti i futjes së nukleotideve është më i madh përballë 5'-T sesa 3'-T i dimerit të timinës, në përputhje me punën e mëparshme që sugjeron se 5'-T mbahet më fort se 3'-T.Për më tepër, futja e A-së përballë të dy T-ve të dimerit duket se ndërmjetësohet nga çiftimi i bazës Watson-Crick dhe jo nga çiftimi i bazës Hoogsteen bazuar në efikasitetet pothuajse identike të futjes së A dhe 7-deaza-A, këtij të fundit i mungon H- aftësia e lidhjes në N7.Efikasitetet relative për futjen e nukleotideve që mund të formojnë çifte bazash Watson-Crick janë paralele me ato për fragmentin Klenow, ndërsa fragmenti Klenow diskriminon më fort kundër mospërputhjeve, në përputhje me selektivitetin më të madh të formës.Këto rezultate nënvizojnë rëndësinë e lidhjes H dhe gjeometrisë së çiftit bazë Watson-Crick në përzgjedhjen e nukleotideve si nga pol eta ashtu edhe nga fragmenti Klen ow, dhe rolin më të vogël të përzgjedhjes së formës në futjen nga pol eta për shkak të saj më të hapur dhe më pak. vend aktiv i kufizuar.