Produktet

Spektroskopia infra të kuqe është përdorur për të hartuar ndërveprimet substrat-proteinë: ndryshimet konformacionale të retikulumit sarkoplazmatik Ca(2+)-ATPase pas lidhjes së nukleotideve dhe fosforilimit të ATPazës u monitoruan duke përdorur substratin ATP dhe analogët ATP (2'-deoksi-ATP, 3 '-deoksi-ATP dhe inozinë 5'-trifosfat), të cilat u modifikuan në grupe funksionale specifike të substratit.Modifikimet në 2'-OH, 3'-OH dhe grupin amino të adeninës zvogëlojnë shkallën e ndryshimit konformacional të ATPazës të shkaktuar nga lidhja, me efekte veçanërisht të forta të vërejtura për dy të fundit.Kjo tregon ndjeshmërinë strukturore të kompleksit nukleotid-ATPazë ndaj ndërveprimeve individuale midis nukleotidit dhe ATPazës.Të gjitha grupet e studiuara janë të rëndësishme për lidhjen dhe ndërveprimet e një grupi të caktuar ligand me ATPase varen nga ndërveprimet e grupeve të tjera ligande.Fosforilimi i ATPazës u vu re për ITP dhe 2'-deoksi-ATP, por jo për 3'-deoksi-ATP.Nuk ka asnjë lidhje të drejtpërdrejtë midis shkallës së ndryshimit konformues pas lidhjes së nukleotideve dhe shkallës së fosforilimit që tregon se shtrirja e plotë e ndryshimit konformues të induktuar nga ATP nuk është e detyrueshme për fosforilimin.Siç vërehet për kompleksin nukleotid-ATPazë, konformimi i ndërmjetësit të parë të ATPazës së fosforiluar E1PCa(2) varet gjithashtu nga nukleotidi, duke treguar se gjendjet ATPazë kanë një konformacion më pak uniform se sa ishte parashikuar më parë.