Produktet

Lëndimi i mëlçisë i shkaktuar nga droga është një nga shkaqet kryesore të konsumimit të drogës.Aftësia për të parashikuar efektet e mëlçisë të kandidatëve për barna nga strukturat e tyre kimike është thelbësore për të ndihmuar në drejtimin e projekteve eksperimentale të zbulimit të barnave drejt ilaçeve më të sigurta.Në këtë studim, ne kemi përpiluar një grup të dhënash prej 951 përbërjesh të raportuara se prodhojnë një gamë të gjerë efektesh në mëlçi në specie të ndryshme, duke përfshirë njerëzit, brejtësit dhe jo brejtësit.Efektet e mëlçisë për këtë grup të dhënash u morën si meta të dhëna pohuese, të krijuara nga abstraktet e MEDLINE duke përdorur një kombinim unik të metodave leksikore dhe gjuhësore dhe rregullave ontologjike.Ne e kemi analizuar këtë grup të dhënash duke përdorur qasjet konvencionale të kimiformatikës dhe kemi adresuar disa pyetje që kanë të bëjnë me përputhjen ndër-speciale të efekteve të mëlçisë, përcaktuesit kimikë të efekteve të mëlçisë tek njerëzit dhe parashikimin nëse një përbërës i caktuar ka të ngjarë të shkaktojë një efekt të mëlçisë tek njerëzit.Ne zbuluam se përputhja e efekteve të mëlçisë ishte relativisht e ulët (rreth 39-44%) midis specieve të ndryshme, duke rritur mundësinë që specifika e specieve mund të varet nga veçoritë specifike të strukturës kimike.Përbërjet u grupuan sipas ngjashmërisë së tyre kimike dhe komponimet e ngjashme u ekzaminuan për ngjashmërinë e pritshme të profileve të tyre të efektit të mëlçisë të varura nga speciet.Në shumicën e rasteve, profile të ngjashme u vunë re për anëtarët e të njëjtit grup, por disa përbërës u shfaqën si të jashtëm.Të dhënat e jashtme ishin subjekt i rigjenerimit të pohimit të fokusuar nga MEDLINE si dhe nga burime të tjera të dhënash.Në disa raste, u identifikuan pohime biologjike shtesë, të cilat ishin në përputhje me pritshmëritë e bazuara në ngjashmëritë kimike të përbërjeve.Pohimet u konvertuan më tej në shënime binare të kimikateve themelore (p.sh., efekti i mëlçisë kundrejt efektit të mëlçisë), dhe modelet binar sasiore të marrëdhënies strukturë-aktivitet (QSAR) u krijuan për të parashikuar nëse një përbërës pritet të prodhojë efekte në mëlçi tek njerëzit.Pavarësisht nga heterogjeniteti i dukshëm i të dhënave, modelet kanë treguar fuqi të mirë parashikuese të vlerësuar nga procedurat e jashtme të verifikimit 5-fish.Fuqia parashikuese e jashtme e modeleve binare QSAR u konfirmua më tej nga aplikimi i tyre në komponimet që u morën ose u studiuan pas zhvillimit të modelit.Sipas njohurive tona, ky është studimi i parë për parashikimin e toksicitetit kimik që aplikoi modelimin QSAR dhe teknika të tjera kimike për të dhënat vëzhguese të krijuara nga mjetet e nxjerrjes së tekstit të automatizuar me kurim manual të kufizuar, duke hapur mundësi të reja për gjenerimin dhe modelimin e toksikologjisë kimike. të dhëna.