Produktet

Struktura e parashikueshme 3D e ADN-së me dy zinxhirë e bën atë të përshtatshëm në mënyrë ideale si një shabllon për dizajnin nga poshtë-lart të vendeve aktive të funksionalizuara të bazuara në acid nukleik.Ne këtu eksplorojmë përdorimin e një dupleksi të ADN-së 14mer si një skelë për pozicionimin e saktë dhe të parashikueshëm të funksionaliteteve katalitike.Duke pasur parasysh pjesëmarrjen e kudogjendur të grupit të imidazolit të bazuar në histidinën në njohjen e proteinave dhe ngjarjet e katalizimit, u hetuan dyplekse të modifikuara të ngjashme me histidinën.Lidhja e histaminës në C5 të bazës së timinës nëpërmjet një lidhje amide, lejon pozicionimin fleksibël të funksionit të imidazolit në brazdë kryesore.Ndërveprimet e ndërsjella midis imidazolit dhe dupleksit dhe ndikimi i tij në imidazolium pKaH hetohen duke vendosur një timinë të vetme të modifikuar në katër pozicione të ndryshme në qendër të spirales së dyfishtë 14mer.Duke përdorur NMR dhe dinamikën molekulare të pakufizuar, krijohet një motiv strukturor që përfshin formimin e një lidhje hidrogjeni midis imidazolit dhe anës Hoogste en të bazave guanine të dy çifteve fqinje të bazave GC.Motivi kontribuon në një stabilizim kundër shkrirjes termike prej 6°C dhe është kyç në modulimin e pKaH të grupit të imidazoliumit.Janë përshkruar tiparet e përgjithshme, parakushtet dhe karakteri gjenerik i motivit të ri rregullues pKaH.