Produktet

Vështrime mekanike në një familje të varur nga Ca2+ të alfa-mannozidazave në një simbion të zorrëve njerëzore.

Bakteret e kolonit, të ilustruara nga Bacteroides thetaiotaomicron, luajnë një rol kyç në ruajtjen e shëndetit të njeriut duke shfrytëzuar familje të mëdha të hidrolazave glikozide (GHs) për të shfrytëzuar polisaharidet dietike dhe glikanet e bujtësit si lëndë ushqyese.Një zgjerim i tillë i familjes GH ilustrohet nga 23 glikozidazat e familjes GH92 të koduara nga gjenomi B. thetaiotaomicron.Këtu tregojmë se këto janë alfa-mannozidaza që veprojnë nëpërmjet një mekanizmi të vetëm zhvendosjeje për të përdorur N-glikanet e bujtësit.Struktura tredimensionale e dy mannozidazave GH92 përcakton një familje proteinash me dy domene në të cilën qendra katalitike ndodhet në ndërfaqen e domenit, duke ofruar ndihmë acide (glutamat) dhe bazë (aspartat) për hidrolizën në një Ca(2+)- mënyrë e varur.Strukturat tre-dimensionale të GH92-ve në kompleks me frenuesit ofrojnë një pasqyrë të specifikës, mekanizmit dhe itinerarit konformativ të katalizës.Ca(2+) luan një rol kyç katalitik për të ndihmuar në shtrembërimin e manozidit nga konformacioni i karriges së tij në gjendjen bazë (4)C(1) drejt gjendjes së tranzicionit. (Bibliografi: Nat.Kimik.Biol.6, 125-32, (2010)

Kromatografia e afinitetit frontal të glikoasparaginave ovalbuminike në një kolonë konkanavalin A-sefarozë.Një studim sasior i specifikës lidhëse të lektinës.

Ndërveprimet e konkanavalinës A (ConA) të imobilizuar nga Sepharose 4B me 10 glikoasparagina të marra nga ovabumina u hetuan në mënyrë sasiore me anë të kromatografisë së afinitetit frontal.Në këtë metodë, një zgjidhje karbohidrate aplikohet vazhdimisht në një kolonë ConA-Sepharose dhe vonesa e pjesës së përparme të elucionit matet si një parametër i forcës së ndërveprimit.Mund të përcaktohet konstanta e disociimit (Kd) për çdo saharid me ConA.Një analizë e lidhjes së p-nitrofenil-alfa, D-mannoside ka treguar se vetitë lidhëse të ConA nuk ndryshojnë në thelb pas imobilizimit në Sepharose 4B.Secila prej glikoasparaginave ovalbuminike u etiketua me tritium me metodën e metilimit reduktiv për analizë.Një krahasim i vlerave të marra të Kd tregoi se lidhja e ConA ndryshon në mënyrë të konsiderueshme me dallime shumë të vogla strukturore të zinxhirit të glikozilit.Rezultatet sugjerojnë që ConA njeh një strukturë specifike të zinxhirit glikozil, Man alfa 1-6 (Man alfa 1-3) Man, në të cilin të paktën një grup hidroksil në pozicionin C-3 të manozës së lidhur me C-6 duhet të jetë i lirë.